Die USS Potemkin wird vor order während den 2340ern in den aktiven Dienst der Sternenflotte gestellt. Alynna Nechayev kann während ihres Dienstes auf dem Schiff bis in die 2350ern eine für die meisten Sternenflottenoffiziere beeindruckende Karriere vorweisen, da sie es binnen kürzester Zeit zum Captain bringt. Das Schiff nimmt am Föderal-Cardassianischen Krieg und später am Tholianischen Krieg, 2353 bis 2360, teil und übersteht zahlreiche Kampfhandlungen.[1]
2366 nutzt Admiral Alynna Nechayev, als Flottenkommandeur der 12. Flotte, das Schiff als Flaggschiff. Diese Funktion fällt dem Schiff bis 2371 zu.[1]2369 ist das Schiff an einem Treffen mit der USS Enterprise-D beteiligt, als eine Gruppe von Borg, angeleitet von Lore, im Beta-Quadranten Unruhe stiften. Nechayev koordiniert die Bemühungen einer Föderatiosflotte diese abtrünnigen Borg dingfest zu machen.[2]
Die Gorkon wird 2371 geentert.
2371 entdecken die Sensoren des Schiffs ein unbekanntes, unbemanntes Raumschiff. Als ein Außenteam, darunter auch LieutenantAidan Thorn, auf das Schiff beamt, wird er schwer verwundet. Dabei verliert er seine Erinnerungen. Die USS Gorkon übergibt Thorn später der USS Endeavour, um ihn in eine medizinische Einrichtung der Sternenflotte zu bringen.[5] Im gleichen Jahr wird das Schiff von fremden Aliens geentert. Im Shuttlehangar können Offiziere die Eindringlinge zurückschlagen.[4]
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